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准备工作:
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在 Windows 界面中搜索 控制面板 打开 程序-程序和功能-启动或关闭 Windows 功能-勾选‘适用于 Linux 的 Windows 子系统’与‘虚拟机平台’后点击确定后重启电脑
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在 Microsoft Store 中下载 Ubunut
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按 Win+X 键 点击 ‘命令提示符(管理员)’ 输入 wsl --install 后回车。下载完毕后关闭即可。 如果遇到链接失败就是网络问题,链接手机热点后重新输入+回车即可
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安装:打开 Ubunut
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将群内的所有压缩包直接保存在D盘
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nupack 安装
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mkdir nupack-latest
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cd nupack-latest
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cp /mnt/d/nupack-4.1.0.1.zip ./nupack-outer.zip
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sudo apt install unzip
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unzip nupack-outer.zip
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unzip nupack-4.1.0.1.zip
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cd ..
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wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
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/bin/bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b
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miniconda3/bin/conda update -n base -c defaults conda
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rm Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
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export PATH=$HOME/miniconda3/bin:$PATH
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echo 'export PATH=$HOME/miniconda3/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
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conda install numpy scipy pip matplotlib pandas jupyterlab
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pip install -U nupack -f ./nupack-latest/nupack-4.1.0.1/package
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jupyter lab
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RNAplot 安装
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mkdir rna
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cd rna
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cp /mnt/d/ViennaRNA-2.7.2.tar.gz ./
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tar -zxvf ViennaRNA-2.7.2.tar.gz
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cd ViennaRNA-2.7.2
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(可能出现报错的解决方法
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sudo apt update
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sudo apt install build-essentia
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sudo apt install pkg-config)
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./configure
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make
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sudo make install
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图片美化方法
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将生成后的svg图片保存在一个文件夹内,并将该文件夹与群内的 py 文件保存在一个文件夹。后 Shift+鼠标右键 点击在此处打开 Powershell 窗口后
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输入命令
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python TrnaStructureBeautifier.py -i 文件夹名称 用于指定一个文件夹
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python TrnaStructureBeautifier.py -i 文件名称 用于指定一个文件 |