升级 NUPACK 4.1 并支持混合材料设计

rna/操作流程.txt

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-准备工作：
-在 Windows 界面中搜索  控制面板  打开 程序-程序和功能-启动或关闭 Windows 功能-勾选‘适用于 Linux 的 Windows 子系统’与‘虚拟机平台’后点击确定后重启电脑
-在 Microsoft Store 中下载 Ubunut
-按 Win+X 键 点击 ‘命令提示符（管理员）’ 输入 wsl --install 后回车。下载完毕后关闭即可。 如果遇到链接失败就是网络问题，链接手机热点后重新输入+回车即可
-
-安装：打开 Ubunut 
-将群内的所有压缩包直接保存在D盘
-nupack 安装
-mkdir nupack-latest
-cd nupack-latest
-cp /mnt/d/nupack-4.0.2.0.zip ./
-sudo apt install unzip
-unzip nupack-4.0.2.0.zip
-cd ..
-wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
-/bin/bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b
-miniconda3/bin/conda update -n base -c defaults conda
-rm Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
-export PATH=$HOME/miniconda3/bin:$PATH
-echo 'export PATH=$HOME/miniconda3/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
-conda install numpy scipy pip matplotlib pandas jupyterlab
-pip install -U nupack -f ./nupack-latest/nupack-4.0.2.0/package
-jupyter lab
-
-RNAplot 安装
-mkdir rna
-cd rna
-cp /mnt/d/ViennaRNA-2.7.2.tar.gz ./
-tar -zxvf ViennaRNA-2.7.2.tar.gz
-cd ViennaRNA-2.7.2
-（可能出现报错的解决方法
-sudo apt update
-sudo apt install build-essentia
-sudo apt install pkg-config）
-./configure
-make
-sudo make install
-
-图片美化方法
-
-将生成后的svg图片保存在一个文件夹内，并将该文件夹与群内的 py 文件保存在一个文件夹。后 Shift+鼠标右键 点击在此处打开 Powershell 窗口后
-输入命令
-python TrnaStructureBeautifier.py -i 文件夹名称  用于指定一个文件夹
+准备工作：
+在 Windows 界面中搜索  控制面板  打开 程序-程序和功能-启动或关闭 Windows 功能-勾选‘适用于 Linux 的 Windows 子系统’与‘虚拟机平台’后点击确定后重启电脑
+在 Microsoft Store 中下载 Ubunut
+按 Win+X 键 点击 ‘命令提示符（管理员）’ 输入 wsl --install 后回车。下载完毕后关闭即可。 如果遇到链接失败就是网络问题，链接手机热点后重新输入+回车即可
+
+安装：打开 Ubunut
+将群内的所有压缩包直接保存在D盘
+nupack 安装
+mkdir nupack-latest
+cd nupack-latest
+cp /mnt/d/nupack-4.1.0.1.zip ./nupack-outer.zip
+sudo apt install unzip
+unzip nupack-outer.zip
+unzip nupack-4.1.0.1.zip
+cd ..
+wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
+/bin/bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b
+miniconda3/bin/conda update -n base -c defaults conda
+rm Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
+export PATH=$HOME/miniconda3/bin:$PATH
+echo 'export PATH=$HOME/miniconda3/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
+conda install numpy scipy pip matplotlib pandas jupyterlab
+pip install -U nupack -f ./nupack-latest/nupack-4.1.0.1/package
+jupyter lab
+
+RNAplot 安装
+mkdir rna
+cd rna
+cp /mnt/d/ViennaRNA-2.7.2.tar.gz ./
+tar -zxvf ViennaRNA-2.7.2.tar.gz
+cd ViennaRNA-2.7.2
+（可能出现报错的解决方法
+sudo apt update
+sudo apt install build-essentia
+sudo apt install pkg-config）
+./configure
+make
+sudo make install
+
+图片美化方法
+
+将生成后的svg图片保存在一个文件夹内，并将该文件夹与群内的 py 文件保存在一个文件夹。后 Shift+鼠标右键 点击在此处打开 Powershell 窗口后
+输入命令
+python TrnaStructureBeautifier.py -i 文件夹名称  用于指定一个文件夹
 python TrnaStructureBeautifier.py -i 文件名称 用于指定一个文件